"Genienes tilbakekomst" er en sammenløyet verdenshistorie, et eksposé over menneskets utvikling fra apestadiet og frem til vår tid - og ytterligere et lite stykke inn i fremtiden. I krønikens form forteller Jersild historien, ikke slik den beviselig gikk til, men som den, på fatasiens villkår, kunne ha blitt. I sluttscenene møter vi de store geniene, Beethoven, Einstein, Picasso og flere, gjenfødt takket være 2000-tallets genteknikk.